旧制第一高等学校（一高）の校長や京都帝国大学の初代文科大学長などを歴任した狩野亨吉（1865～1942）の遺蔵資料群で主に校務文書・個人書簡・日記が含まれています（公開は一部）。
資源科学研究所が収集・保持してきた資料のうち、本草学に関連する約1,700冊のコレクションです。 なお、新日本古典籍総合データベース（http://kotenseki.nijl.ac.jp/page/list-toky-koma.html）で、江戸期の和書の一部（219点632冊）が公開されています。
海軍省が日本海志を編纂するために収集した資料で、戦後、駒場図書館に移されました。特に水軍書と造船関係資料が充実しています。
第一高等学校で使われていた視覚教材（人体・動植物・実験機器などの絵、歴史教育用の地図、語学教育のための絵など）をディジタル化しています。
